I Pergola utvecklar spelarna sina trädgårdar, odlar nya växter och lockar till sig insekter och smådjur.
Under sin tur väljer en spelare ett av de fyra tillgängliga verktygen, tar de presenterade föremålen och placerar dem i sin trädgård. Därefter utför de den handling som motsvarar det valda verktyget. Eftersom spelarna har stor frihet i hur de arrangerar växterna i sina trädgårdar, ser varje trädgård helt annorlunda ut efter femton rundor – och poängsätts därefter. Den spelare som samlar flest poäng vinner.